مجله دانشگاه علوم پزشکی ایلام، جلد ۱۷، شماره ۳، صفحات ۱-۱۰

عنوان فارسی بررسی کارایی روشLAMP (Loop-mediated isothermal DNA amplification)
چکیده فارسی مقاله مقدمه:سالمونلاها از مهمترین باکتری های بیماری و عامل تیفوئید، باکتریمی، آنتروکولیت و سالمونلوز است که از عفونت های مشترک انسان و حیوانات می باشد. بیماریهای ناشی از این عامل یک معضل بزرگ بهداشتی در جهان به خصوص در کشورهای در حال توسعه از جمله کشور ما می باشد. بنابراین تشخیص سریع، دقیق و به موقع آن برای جلوگیری از اپیدمی و عوارض مخرب این باکتری ضروری به نظر می رسد. برای تشخیص سالمونلا روش های مختلفی وجود دارد که می توان به روش کشت، Immunoassay، و روش های مولکولی PCR ، Real-time PCR اشاره نمود. تمام این روش ها به زمان طولانی، تعداد زیاد باکتری درنمونه اولیه، تجهیزات گران قیمت آزمایشگاهی و به افراد متخصص در این زمینه نیاز دارند. هدف از این مطالعه بررسی کارایی روش نوین تشخیص مولکولی LAMP با روش PCRدر تشخیص عامل عفونی ســالمونلا تیفی می باشد. مواد و روش ها: در این تحقیق روش PCR با روشLAMP جهت تشخیص 7 سویه سالمونلای مختلف مورد بررسی و مقایسه قرار گرفتند. ژنوم باکتری ها طبق روش استاندارد استخراج و با پرایمرهای اختصاصی در دستگاه PCR بر اساس برنامه چرخه حرارتی تشخیص داده شدند. و در مقایسه با آن مجموعه پرایمرهای اختصاصی به روش LAMPدر یک دمای واحد در بلوک حرارتی ساخته شده در داخل کشور تکثیر و محصولات ایجاد شده در ژل الکتروفورز از طریق بررسی ایجاد کدورت به روش چشمی مورد تشخیص قرار گرفتند. یافته های پژوهش: بررسی نتایج دو روش در تشخیص مولکولی سالمونلاها نشان داد که روشLAMP سریعتر، ارزان تر و اختصاصی تر است و به جای دستگاه گران قیمت PCR و برنامه چرخه حرارتی چند دمایی آن با استفاده از یک بلوک حرارتی بسیار ساده و ارزان ساخت داخل کشور و در یک دمای واحد 62 درجه سانتی گراد و همچنین با مشاهده کدورت حاصل از فرایند تکثیر ژن ها در روش جدید در مقایسه با روش الکتروفورز در بررسی محصولات PCR در زمان کوتاه تری به تشخیص اختصاصی این سالمونلا ها پرداخت. بحث و نتیجه گیری: این روش می تواند جهت تشخیص مولکولی سریع، دقیق و ارزان با کاربرد گسترده در آزمایشگاه های تشخیصی و بخصوص تشخیص عوامل عفونی در آزمایشگاه های مناطق محروم و همچنین آزمایشگاه های سیار مورد استفاده قرار گیرد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله سالمونلا، تشخیص مولکولی، PCR، DNA،LAMP

عنوان انگلیسی Evaluation of LAMP (Loop-mediated isothermal DNA amplification) for Molecular Detection of Salmonella
چکیده انگلیسی مقاله Introduction: Salmonella Bacterium is not only a causative factor of typhoid fever, enterocolitis, and salmonellosis, but it is also a zoonotic infection. This bacterium is a major health problem throughout the world, and is especially prevalent in developing countries. Therefore, rapid diagnosis of salmonella can prevent its outbreak. Different techniques are used for the diagnosis of Salmonella bacteria, such as culture, biochemical, serological, ELISA, Widal, immunofluorescence and molecular methods like PCR and Real time PCR,all of which are difficult, time-consuming, and expensive. Thus, our study was designed to evaluate the LAMP (Loop-mediated isothermal DNA amplification method) for detection of salmonella bacteria. Materials & Methods: In this study, we examined 7 different strains of salmonella. The DNA was extracted by standard methods and amplified with specific primers by PCR and set of primers for LAMP in single temperature in very simple thermal block made in Iran. The amplified products were detected by gel electrophoresis and LAMP products were visualized by their turbidity with naked eye. Findings: Conventional PCR method for detection of Salmonella needs standard thermocylcer and takes 3 hours, but using LAMP method, we were able to amplify and detect salmonella in simple thermoblock, taking much less time. After optimization of the process, it was, soon, possible to detect and identify Salmonella typhi bacteria within 90 minutes. This method is also 10 times more sensitive than that of the PCR. Discussion & Conclusion: According to the results, comparing LAMP method for detection and identification of Salmonella with conventional PCR, we have been able to determine the simplicity, speed and the superior sensitivity of the LAMP method. This Method is more simple, faster and cheaper. Non-dependence of cycle's temperature and thermo-cycling and replacement with one thermo block which is very simple, inexpensive and made inside the country, can be considered another advantage of the LAMP method.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله Salmonella, molecular detection, PCR, DN, LAMP

نویسندگان مقاله علی کرمی | ali karami



نشانی اینترنتی http://sjimu.medilam.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-98&slc_lang=fa&sid=fa
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/48/article-48-23550.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده عمومی
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات